本文将把中西医发展历史大致划为五个阶段进行比较。以此来比较相同时期中西医的异同。
1，史前时代。因为在这个阶段，人类文明都刚刚发展，无论东西方都还处于一种较为蒙昧的状态，科学技术发展十分落后。在这个条件下，东西方之间的差异可以说十分之小，都还处于一种经验上的积累，对日常生活的观察和简单思考。不论是东西方都没有出现系统性的医学理论。这段历史我们目前也是所知甚少，不过“一方水土养一方人，故大胆猜测，因为东西方地理上的各种差异，比如海洋文明就更容易让人开扩进取，农耕文明更容易让人安土重迁，还有由于气候等自然因素造成动植物生长的差异就在一定程度上埋下了中西方日后分流的情况。今天花朵的差异不是现在一天造成的而是以前埋下了不同的种子。
2，轴心时代。在这个阶段东西方的人类都进入了一个伟大的时代。科学技术，思想文化，社会制度，都进入到一个大变革时代。而中西医在此时虽然有很多共同之处但也有了明显的差异。首先，从“同”的角度讲，中西医都没有摆脱“神”的影响，从文字记载中可以看到很多疾病都被中西方归入到鬼神的影响。而且中西方很多时候受技术限制都处于一个对自然人体疾病的表象观察。然后从“异”的角度讲，西方更多的侧重“眼见为实”，更较为注重肉眼的观察，以还原论的哲学思维来指导医学发展，从部分去研究整体，在亚历山大利亚时期，解剖学和生理学的研究积累了大量对人体的观察资料，并奠定了日后西医以解剖结构研究为起点，探讨结构与功能关系的医学进路的基础。而中医的指导哲学思想来源于《易经》《黄帝内经》，由“气一元论”得出“万物皆一体”，万物皆有联系，强调天人相应。在这种思想的指导下，中医乃至中国文化都显出了不一样的色彩。比如未来社稷的祸福难以预测，就可以通过星象来预测。疾病在人体中难以观测，就可以通过脉象，面相等其他方法来推测。这是中医特有的象思维。但其中也蕴含着深刻复杂的逻辑推论。
3，中世纪。在这个阶段西方受战争和宗教神学的影响，和科学技术的限制，西医的发展停滞不前，很多还是通过类似肉眼观察来判断疾病，总体并未得到更大的发展，甚至有些衰退。而中医在这段时间却获得了巨大的发展，涌现出了一大批伟大的中医。他们使中医的理论更加系统化，更加理论化，思辨化。如医圣张仲景，写出传世巨著《伤寒杂病论》，并提出六经辨证法，为后世医家所尊崇。总的来说这个时间段内，中医可以说是处于世界领先水平。并且中医受到儒家等思想影响，是中医具有浓厚的文化气息，和注重医德培养，这对于现在也是具有学习意义。
4，近代。在这个时间段，西方爆发了轰轰烈烈的工业革命，科学技术迅猛发展，化学制药等工艺迅猛发展，显微镜等一系列发明将人类带入微观时代，这个时间内西医与现代自然科学结合，取得了巨大的发展。而中医由于当时的社会环境闭塞，没能接触到先进的科学技术造成了中医一定程度的落后，不过中医并未停止发展，明末之时，温病流行，出现了温病四大家，他们大大扩展了中医的理论范围，提高了中医治疗水平。他们的理论到现在在治疗冠状病毒方面仍有巨大的实践意义。总的来说，这个时间段内西医由于科学技术的迅猛发展确实取得了巨大进步，在一定程度上超过了中医。不过这样造成了一个重大误区，以至于现在还有少部分人深信不疑，他们认为中医就是传统医学，西医就是现代医学。诚然这个时间段内中医确实还处于传统医学阶段，但他们却无视甚至否认中医以后的发展。在此想澄清，判断传统和现代医学的标准应该是是否使用现代技术，而西医不等于现代技术，中医不等于传统技术。
5，现代发展。到了现代以来，以前一直有声音在迷信西医，可随着医学实践的不断发展，西医出现了一系列的问题，而许多开明西医在中医上发现解决之道。而中医也随着社会的发展不断学习掌握先进技术，并借鉴了西医的一些标准化观念，从而促进了中医的现代化发展。从这个角度讲目前中西医是在不断交流发展的互相的理念不断交流碰撞，可以说这是历史上从未有过的。
综上，同：
1.起源：都来源于人类的生活实践，是人类祖先集体智慧的结晶。
2.中医与西医都是一门独立的科学理论体系，都是研究疾病的发生、发展、诊断、治疗、预后与转归的科学。
3.中医与西医的研究对象主要都是人体.。
4.都受当时经济政治社会影响。
5.都为人类健康服务。
6.有相同的思想阶段。
异：
1.历史时代的差异
2.经济政治的差异，中医：中国2000多年封建社会的发展与近代的衰落和改革到如今的复兴繁荣；而西医：西方中世纪的凋敝，到16世纪革命和现代化体系的建立。
3.思想文化的差异：中医：象思维，朴素唯物主义和自然辩证法思想；西医：机械论，还原论
4.科学技术：中世纪中国发达的古代科学技术为中医的发展助力，而近代科技革命，科学技术为西医提供全新的营养，但中医并未在此时期吸收科技成果。
5.中医产生于生产力发展水平低下和科学技术落后的古代社会,它以朴素的唯物论和自发的辩证法为指导,属经验医学模式;而西医起源于西方国家，我们称之为“现代医学”，其形成及发展都必须依赖于药物化学、分子、细胞、生物学的发展和科学的进步。
6.中医属于经验医学模式; 文艺复兴以后，西方医学开始了由经验医学向实验医学的转变。
结尾，从历史的角度来看，无论是中医还是西医都受到了当时社会环境，哲学观念等影响，故我们应当为中西医的发展创造更加宽松的社会环境，这对医学的进步是有好处的。再说无论是中医还是西医，从本质上讲都是一种医术，都是以治病救人为目的。从这个角度说是完全一致的，这也是为什么中西医能共同发展，共同进步。我们应该学习古仁人之心，摒弃门户之见，博百家之长，为人类的健康卫生事业贡献出我们的一份力量。
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