相同:
他们的发展最终都是要想要更好的医治病人，医学水平的不断提高，为了人类的健康而努力奋斗。中医和西医都是人类经济和科技发展的文明产物，都有着悠久的历史。都是从粗糙向精细而进化。然后借助着科技的水平逐步的完善。
不同:
一.有着不同的理论体系，因此发展的针对方向不同。如我国是农耕文化传承下来的，他对草药有很深的研究，从不同的方剂中可以提现出众多草药的多种用途，从单味药，到成熟的方剂，不光有在方剂这方面，还在针灸，推拿等等方面提现。在中国几千年的历史上，长期占统治地位的是朴素唯物主义和自然辩证法思想，其核心思想是元气论、阴阳学说、五行学说，注重整体、分化、相互作用、内在矛盾，形成有机性观点和朴素系统论思维。对中医学产生了深远的影响，中医吸收这些思想并把它贯彻到医学研究中，形成中医学基本观点和朴素系统论思维方式。
在西方历史上，在古希腊、罗马时期，占统治地位的是机械唯物主义的原子论和元素论，中世纪时期宗教神学压倒了一切，近代以来则形成了继承古代机械唯物论传统的新型机械唯物主义。对西医学现有体系产生直接影响的，主要是近代以来的西方哲学思想。注重粒子、实体、组合、可分解性、外部作用，西医学吸收这些思想并把它贯彻到医学研究中，形成西医学的基本观点和还原论思维方式。
二.科学和技术的差异。医学为了解答关于人的健康与疾病的具体问题，需要吸收和运用恰当的科学知识和技术手段，由此转化为医学的科学技术内涵，中西医之间的差异在许多方面表现为科学技术内涵的差异。医学自身的思维方式支配着医学研究的方向，它只选择和吸收适合自己需要的科学技术。中国与西方欧洲的科学技术发展在不同的历史时期有着不同的成就和水平，为医学提供了不同的科学技术营养.
无论是中国还是西方在476年以前，科学技术与自然哲学没有分化。中医学和西医学分别的吸收了当时的一些自然哲学形态的知识，在科学技术内涵上开始出现一些差异，但那时候还只是差异的萌芽。
中世纪时期扩大了中西医之间科学技术内涵的差异。中国古代科学技术发展到鼎盛时期，科学技术内涵的性质和水平是属于古代科学的，中医学的许多理论和技术手段正是在这个时期发育起来的。而欧洲的科学技术和医学一起成为宗教神学的牌女，其科学技术内涵降到了最低点.
16世纪以后的几百年决定性的加深了中西医之间科学技术内涵的差异。当欧洲的科技革命的成果向中国传播的时候，中医学却陷入了为存亡而斗争的困境，失去了吸收新的科技成果的条件。西医学则不同，近代科技革命为西医学提供了全新的营养，出现的新进展、新成果几乎都是靠移植运用新的科学知识或技术手段完成的，到了离开科学技术的支持寸步难行的程度。
中西医之间现有的在科学技术内涵上的差异，是两种医学吸收科学技术的两种不同历程演变到今天的结果。
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